ابوالفرج اصفهاني شهادت ابوبكر را قبل از حضرت قاسم دانسته است. [1] ولي برخي ديگر از منابع شهادت وي را بعد از حضرت قاسم گزارش نموده اند. [2] در زيارت رجبيه اين فرزند امام مجتبي عليه السلام مورد سلام امام واقع شده است. در زيارت ناحيه مقدسه آمده: «السلام علي ابي بكر بن الحسن؛ سلام بر ابوبكر پسر حسن» سپس از تير سه شعبه كه بر بدن او وارد شده بود، ياد شده و قاتلش «عبدالله بن عقبة غنوي» نفرين شده است. [3] .