امام عليه السلام در آخرين لحظات عمر شريفش با خدا راز و نياز نموده با اين جملات مناجات مي كرد:

صبرا علي قضائك يا رب لا اله سواك يا غياث المستغثين مالي رب سواك و لا معبود غيرك صبرا علي حلمك يا غياث من لا غياث له يا دائما لا نفاد له يا محيي الموتي يا قائما علي كل نفس بما كسبت، احكم بيني و بينهم و انت خير الحاكمين [1] .

بر قضا و حكم تو اي خدا صبر پيشه سازم، خدايي بحز تو نيست اي فريادرس استغاثه كنندگان! پروردگاري براي من غير تو نيست و معبودي بجز تو ندارم، بر حكم تو صبر مي كنم اي فريادرس كسي كه جز تو فريادرسي ندارد و اي كسي كه ابدي و دائمي هستي و مردگان را زنده مي كني، اي آگاه و شاهد و ناظر بر تمام كردار و افعال مخلوق خود! تو در ميان من و اين گروه حكم كن كه تو بهترين حكم كنندگاني.