سومين علت شكست نهضت زيد عليه السلام اختلاف آراء و عقايد مسلمانان و اطرافيان زيد عليه السلام در مسأله ي خلافت بود. زيد بن علي عليه السلام همه ي طوايف مسلمانان را به قيام عليه بني اميه دعوت كرد و او ارتشي عظيم از همه ي مسلمانان آن روز كه به شكلي نسبت به حكومت بني اميه بدبين و مورد ستم بودند، تشكيل داد. اما در زمان قيام، مسأله ي مهم خلافت، به عنوان يك مسأله ي مهم اعتقادي بين مردم مورد بحث بود و مرتب نظر او را درباره ي خلافت جويا مي شدند. زيد عليه السلام نيز براي جلوگيري از تفرقه و اختلاف و ايجاد الفت و اتحاد بين مسلمانان، سعي داشت به نحوي پاسخ دهد كه موجب از هم پاشيدگي مردم نشود.