امام حسين عليه السلام علاوه بر تطبيق بعضي آيات شريفه بر اهل بيت عصمت عليهم السلام برخي ديگر از آيات را خصوصاً بر اميرمؤمنان علي عليه السلام تطبيق مي كرد و مي فرمود: اين آيه در شأن مولا علي عليه السلام نازل شده است. در اين جا چند مورد از آنها را ذكر مي كنيم:

الف) امام عليه السلام در تفسير آيه شريفه «تراهم ركّعاً سجّداً» [1] ؛ «آنان را در حال ركوع و سجود بسيار مي بيني»، فرمود: اين آيه شريفه در شأن علي بن ابي طالب عليه السلام نازل شده است. [2] .

ب) همچنين امام باقر عليه السلام، از امام سجاد عليه السلام، از جدّش نقل مي كند كه وقتي آيه شريفه «و كلّ شي ء أحصيناه في امام مبين» [3] ؛ «و همه چيز را در كتابي روشنگر برشمارده ايم، بر پيامبر اكرم صلي الله عليه و آله و سلم نازل شد، ابوبكر و عمر از جاي برخاستند و گفتند: اي رسول خدا! آيا امام مبين، تورات است؟ فرمود: نه. عرض كردند: انجيل است؟ فرمود: نه. سؤال كردند: قرآن است؟ فرمود: نه. در اين هنگام اميرمؤمنان عليه السلام وارد شد. پيامبر خدا صلي الله عليه و آله و سلم به علي عليه السلام اشاره نموده و فرمود: امام مبين، اين است. حقّا كه او همان امامي است كه خداي تبارك و تعالي علم هرچيزي را در آن به شمار آورده است. [4] .

ج) امام مي فرمايد كه از پيامبر صلي الله عليه و آله و سلم درباره آيه «طوبي لهم و حسن مآب» [5] سؤال شد. پيامبر فرمود: اين آيه درباره اميرمؤمنان علي عليه السلام نازل شده است و «طوبي» درختي است در خانه علي كه در فردوس مي باشد و هيچ ميوه اي از ميوه هاي بهشتي نيست، مگر آن كه در آن خانه موجود است. [6] .

د) حارث بن اعور به امام حسين عليه السلام گفت: فدايت شوم اي فرزند رسول خدا! مرا از فرمايش خدا در كتاب خويش خبر ده كه مي فرمايد: «و الشمس وضحها» [7] منظور چيست؟ فرمود: «ويحك يا حارث ذاك محمد رسول اللّه؛ اي حارث! اين محمد رسول خداست عرض كرد: فدايت شوم منظور از «والقمر اذا تلاها» چيست؟ فرمود: منظور اميرمؤمنان است كه پشت سر پيامبر صلي الله عليه و آله و سلم بود. عرض كردم: منظور از «والنّهار اذا جلاّها» چيست؟ فرمود: آن قائم آل محمد است كه زمين را پر از عدل و داد مي كند. [8] .