واتخذ أعضاء المؤتمر بالاجماع القرارات التالية، وهي:

1 - أن يكون شعار المعركة دم عثمان، والمطالبة بثاره لانه قتل مظلوما، واستباح الثوار دمه بعد توبته بغير حق، لقد رفعوا قميص عثمان شعارا لهم فكان شعارا للتمرد وشعارا للرأسمالية القرشية التي طغت في البلاد. 2 - تحميل الامام علي (ع) المسؤولية في اراقة دم عثمان لانه آوي قتلته، ولم يقتص منهم. 3 - الزحف الي البصرة واحتلالها، واتخاذها المركز الرئيسي للثورة لان لهم بها حزبا وأنصارا، وقد أعرضوا عن الزحف الي يثرب لان فيهما الخليفة الشرعي، وهو يتمتع بالقوي العسكرية التي لا قابلية لهم عليها، كما أعرضوا عن التزوج الي الشام لان الامويين لم يستجيبوا لهم، لانها كانت تحت قبضتهم، فخافوا عليها من التصدع والاحتلال.