در تعداد فرزندان آن حضرت بين مورخين اختلاف است:

بعضي گفته اند: آن حضرت چهار پسر و دو دختر داشته اند

پاره اي نوشته اند: براي آن جناب شش پسر و دو دختر بوده

و گروهي هم خاطرنشان كرده اند كه آن حضرت شش پسر و چهار دختر داشته اند و اصح اقوال همين قول است، فرزندان آن حضرت عبارتند از:

1- علي اكبر كه در كربلاء با آن حضرت شهيد شد و مادر آن حضرت عليا مخدره ليلي بنت عروه مي باشد

2- علي اوسط ملقب به امام زين العابدين عليه السلام كه مادر ايشان شاه زنان بوده.


3- علي اصغر كه طفل شيرخوار بود و در كربلاء شهيد شد.

4- محمد كه وي نيز در كربلاء با پدر بزرگوارش شهيد شد.

5- عبدالله كه آن طفل يكساعته بوده و در كربلاء شهيد شد.

6- جعفر كه مادرش قضاعيه مي باشد، وي در زمان حيات پدر از دنيا رفت.

7- فاطمه صغري، وي خواهر عبدالله است كه در ظهر عاشوراء متولد شد و در دامن پدر كشته گرديد، اين بانو در مدينه گذاشته شد و به كربلاء نيامد.

8- سكينه كه مادرش ربابه دختر امرء القيس مي باشد، وي ابتداء با مصعب بن زبير و پس از فوت وي با عبدالله بن عثمان بن عبدالله بن حكيم بن حزام ازدواج كرد و پس از فوت او به عقد اصبغ بن عبدالعزيز بن مروان درآمد و قبل از تماس از وي جدا شد، اين مجلله همچنان حيات داشت تا ايام هشام بن عبدالملك و در عصر وي بدرود حيات گفت.

9- فاطمه كبري وي ابتداء نزد حسن بن حسن بن علي عليهماالسلام بود و پس از وي با عبدالله بن عمر بن عثمان بن عفان ازدواج كرد و از او صاحب فرزندي شد معروف به ديباج، مادر اين بانو، ام اسحق مي باشد

10 - رقيه كه مادرش شاه زنان بوده و با پدر از مدينه خارج شد و به كربلاء آمد و در شام در سن پنج سالگي و به قولي هفت سالگي از دنيا رفت.