در روايات آمده است كه نامگذاري آن حضرت و برادر بزرگوارش به حسين و حسن، توسط شخص پيامبر اكرم صورت گرفته است و تصريح شده است كه اين نامگذاري به دستور خداوند متعال بوده است.

از علي بن ابيطالب نقل كرده اند كه فرمود: آن گاه كه حسن به دنيا آمد نام عمويم «حمزه» را بر او نهادم و آن گاه كه حسين متولد گشت نام عموي ديگرم «جعفر» را بر او گذاشتم روزي رسول خدا(ص) مرافراخواند و فرمود: من مامور شده ام كه نام آن دو را تغيير دهم، از اين پس آنان را حسن و حسين بخوانيد [1] .

در روايات ديگر آمده است كه پيامبر اكرم (ص) فرمود: حسن و حسين را به نام فرزندان هارون ناميدم، او فرزندانش را «شبر» و «شبير» ناميد و من فرزندانم را به همان نام (به لفظ عربي) حسن وحسين ناميدم [2] .