مرحوم شهرستاني پس از 60 سال عمر باعزت و پرتلاش، سرانجام در روز پنج شنبه سوم شوال 1315 ه. در كنار حرم مطهر سالار شهيدان ديده از جهان فروبست، و در رواق مطهر در ايوان متصل به قبور شهدا مدفون گرديد. [1] .

پس از درگذشت وي رياست كبري و مرجعيت تقليد به پسرش حاج ميرزا علي شهرستاني رسيد. [2] .

حاج ميرزا علي شهرستاني آثار فراواني دارد از جمله:

1- الدرة الوجيزه، در شرح وجيزه 2- الجامع، در ترجمه ي شرح باب حادي عشر 3- ذخائر الأحكام 4- التبيان، در تفسير غريب قرآن 5- الدر الفريد، در عزاداري سبط شهيد 6- كشف الحجاب 7- شرح خلاصة الحساب 8- البيان المبرهن 9- محاسبة النفس 10- التذكره، در شرح تبصره، 11- التحفة العلويه 12- منتخب الادلة 13- الصحيفة النبويه 14- نتيجة الفكر في الولاية علي البكر 15- خيرة الطيور 16- قبلة البلدان 17- رجم الشياطين 18- وظائف الجوارح 19- كنز الفوائد 20- فقه الأطباء.

و دهها كتاب ديگر در فقه و اصول و تفسير و كلام و درايه و غيره [3] او به سال 1344 ه. در كربلا درگذشت.

پسر ديگرش سيد جعفر شهرستاني در مشهد اقامت داشت [4] و آخرين پسري كه از


ايشان سراغ داريم سيد زين العابدين شهرستاني است كه خود رد «موائد» از او نام برده است. [5] .